独占集群多节点任务使用方法

  1. 申请独占集群,配置好节点数量。

  2. 激活mpi环境:

. /opt/intel/bin/compilervars.sh intel64
  1. mpirun程序

mpirun -genv I_MPI_PIN socket -machinefile mmf -np 8 -perhost 2 YouPr

其中-machinerfile可以指定程序在哪些节点上运行,mmf为节点文件,如下所示:

1n2
2n2
3n3
4n3
5n4
6n4
7n5
8n5

-np是进程数,-perhost是在每个节点上运行作业数目YouPr是要运行的程序。

注意

不建议将头节点作为计算节点,否则会内存不足报错会强制退出。